蛔虫感染在临床上大多没有明显的症状，幼虫在体内移行时，可以引起呼吸道或者过敏的症状，成虫在小肠内寄生可引起腹痛等胃肠功能紊乱，少数患者发生胆道蛔虫症或者是肠梗阻等严重的并发症，会出现腹痛、发热等症状。
如果蛔虫幼虫在体内移行，会引起全身症状，例如低热、乏力，少数患者会有皮疹的出现，可引起呼吸道症状，例如阵发性咳嗽，咳嗽中可以带血丝，一般7-10天上述症状可以自行缓解。蛔虫最常寄生的部位是在小肠，有的时候会引起食欲减退、恶心、腹泻、便秘等症状，可以从大便中排出蛔虫或者吐出蛔虫。