脂肪肝会引起肝区疼痛，主要表现为右上腹压迫感或者胀满感。由于肝脏明显增大，肝细胞被脂肪浸润导致肝脏肿大，肝包膜被过度伸张而引起胀痛。有25%的脂肪肝患者没有任何症状，仅是在体检或者行超声检查、CT检查时发现脂肪肝，故一部分脂肪肝患者在早期容易被忽视，或者延误诊治。
随着病情的发展，患者逐渐会出现不适的症状，例如乏力、食欲减退、右上腹轻微胀痛，进食后可以出现上腹胀满或者嗳气，个别患者可以出现恶心、呕吐。另外，可以合并维生素缺乏的表现，如末梢神经炎、舌炎、口角炎、角膜干燥等。脂肪肝可以发展为肝硬化，可以出现黄疸、腹水等症状。