微小病变型肾病分为原发性微小病变型肾病、继发性微小病变型肾病，病因有所不同。
1、原发性微小病变型肾病：病因不明
2、继发性微小病变型肾病：
（1）药物：如非甾体类抗炎药、锂制剂等。非甾体类抗炎药抑制前列腺素合成，降低其维持肾脏血流灌注和代谢的功能，导致肾损伤。
（2）中毒：如汞中毒，蓄积在肾脏，使肾脏上巯基酶失活改变细胞膜通透性，造成离子失衡细胞损伤。
（3）肿瘤：如霍奇金淋巴瘤等，通过浸润肾脏、压迫肾相关的血管输尿管等造成肾损伤。