真菌不同于细菌和病毒，它是真核生物。临床上常见的真菌感染为隐球菌、酵母菌及霉菌感染，酵母菌感染一般分为白色假丝酵母菌感染和非白色假丝酵母菌感染，霉菌感染一般为曲霉菌感染，在治疗上隐球菌及白色假丝酵母菌一般首选氟康唑治疗，非白色假丝酵母菌，比如光滑假丝酵母菌等，可以选用卡泊芬净、伏立康唑等，曲霉菌感染一般选用伏立康唑较多。临床上用药需结合患者病情、病原学、药敏试验等选择敏感抗生素。