微动脉位于微循环的起始部，遍布于全身各脏器与组织，是心血管系统与组织直接接触的部分。其直径一般小于300μm，靠近毛细血管处可减小到30-75μm，内皮腔面有少许短的微绒毛。
在大部分器官和组织内，微动脉内皮细胞含很多微丝临近细胞表面。微动脉包括内膜、中膜和外膜，均较薄，内、外膜下无内弹性膜，中膜含有1-2层平滑肌纤维。
微动脉参与构成微循环，是血液与组织液进行物质交换的场所，帮助向全身各脏器和组织提供营养和养料，从而让各个脏器以及各个组织可以正常运转。
而且微动脉位于微循环的起始部位，其收缩与舒张能显著调节器官和组织的血流量，是微循环的总闸门，还可改变外周血流的阻力，调节血压。