1、血常规检查：通过进行血常规检查，分析血象白细胞、淋巴细胞、中性粒细胞的变化，可以初步判断是病毒还是细菌感染。
2、咽拭子培养检查：对咽部分泌物进行进行细菌培养、药敏试验检查，有助于明确是哪种病菌感染，以及对后续选择治疗药物有帮助。
3、免疫检查：进行风湿三项检查、自身抗体检查、淋巴细胞亚群检查等免疫功能检查，可以诊断患者有无免疫缺陷。
4、胸部X线、CT：通过胸部影像学检查，除了可以明确感染部位之外，还可以发现患者有无先天性支气管发育异常等疾病。
5、肺功能检查：肺功能检查可以反应肺弥散、通气换气的能力，从侧面反应病情严重程度。
6、C反应蛋白(CRP)：细菌感染时，CRP浓度上升，非细菌感染时则上升不明显。
7、血清特异性抗体检测：主要检测IgM和IgG抗体。发病早期血清中抗体以IgM为主，但持续时间较短，后期或恢复期抗体以IgG为主，持续时间较长。
8、细菌培养和药敏：取痰液、血液等进行细菌培养可明确病原菌，同时进行药物敏感试验。
9、支气管镜检查：包括纤维支气管镜检查、呼吸道黏膜光镜检查、呼吸道黏膜电镜检查等。
10、人抗链球菌溶血素O(ASO)：部分患儿感染时血中ASO滴度增高，提示链球菌感染，多见于扁桃体反复化脓者。