按照目前中国大部分医院的分科体系，眩晕科不属于任何科室，可以开设眩晕门诊的科室有耳鼻咽喉头颈外科和神经内科。因为眩晕是一个症状，很多疾病都可以引起眩晕，最常见的是耳部疾病和脑部疾病，因此耳鼻咽喉头颈外科和神经内科都可以开设眩晕门诊。
在不同科室的眩晕门诊就诊时，诊治的疾病可能不同，耳鼻咽喉头颈外科一般诊治耳石症、梅尼埃病等引起的眩晕，神经内科一般诊治脑供血不足、脑梗、脑出血等引起的眩晕。