长期腹泻的原因，包括以下几方面：
一、全身疾病，具体如下：1、糖尿病腹泻，与胃肠道植物神经病变有关；2、甲状腺机能亢进，由于肠道蠕动快，消化、吸收不良而出现腹泻；3、慢性肾功能不全，尿毒症；4、自身免疫性疾病，如系统性红斑狼疮、硬皮病。
二、肝胆胰腺疾病，具体如下：1、肝炎、肝硬、化肝癌；2、慢性胰腺炎、胰腺癌；3、胆囊切除后。
三、胃肠道疾病，具体如下：1、胃肠道肿瘤；2、炎症性肠病；3、功能性肠易激综合征、功能性腹泻；4、感染性肠结核、阿米巴肠病、慢性菌痢、真菌感染；5、药源性，多种药物或药物间相互作用可以引发慢性腹泻。