附睾炎最常见的致病原因是感染，可由不洁性行为造成淋病，或由沙眼衣原体感染引起，也可因先前存在的尿路感染或其他邻近器官炎症扩散造成。
一、主要病因
1、泌尿系感染：沿输精管蔓延到附睾所致，经尿道器械操作、频繁导尿、前列腺摘除术后留置尿管等均是引起附睾炎的因素。
2、治疗不彻底：急性附睾炎治疗不彻底可转为慢性附睾炎。常见的致病菌为大肠杆菌，其次是变形杆菌、葡萄球菌、肠球菌及绿脓杆菌等，沙眼衣原体也可引起急性附睾炎。致病菌多经输精管逆行进入附睾。
3、细菌感染：细菌侵入附睾也可经淋巴管或经血行感染引起附睾炎，但少见。
4、尿液返流：若患者生殖器官异常的抬升或受压，会造成尿液反流至附睾，进而可引起化学性附睾炎。
二、诱发因素
1、不良性行为，如与有性传播感染风险的伴侣发生性关系、性生活中不使用安全套、有性传播感染史等，均会增加经性传播感染附睾炎的风险。
2、尿路感染，患前列腺炎或其他部位尿路感染的患者，较常人更容易出现附睾炎。
3、近期接受过尿路器械检查、治疗、手术或有留置尿管者。
4、各种原因导致的泌尿系统解剖结构或功能异常。
5、全身疾病或免疫抑制因素。
6、某些药物可能存在诱导出现附睾炎的效应，如胺碘酮。
7、外伤，如阴囊损伤、腹股沟损伤也可引起附睾炎，但不多见。