腘动脉瘤的主要治疗方式为开放外科手术治疗，不适合做血管腔内治疗。通常手术短期治疗即可改善症状，但患者动脉硬化的症状需要长期持续性治疗。
一、药物治疗
1、抗凝药(抗凝血剂)：如华法林、利伐沙班等，减少血液中凝血血小板数量的药物可以降低动脉撕裂形成凝块的风险。
2、抗生素：手术前常规应用抗生素1~2天，手术前预防性应用抗生素可以显著降低患者手术后感染的风险，有助于患者的恢复，手术前常用的抗生素包括青霉素、万古霉素、头孢类抗生素等。
二、手术治疗
1、手术指征：因为动脉瘤易发生危及肢体的栓塞事件，造成截肢等严重并发症，因此一经发现均需要积极手术治疗。
2、手术治疗：原则以动脉瘤切除、血管搭桥、解除压迫和恢复腘动脉血供为主，即在以下肢缺血起病的病例，切除动脉瘤并搭桥的同时还需行远端动脉取栓，保证肢体远端血供恢复。
3、手术方式：
（1）完全切除动脉瘤，腘动脉对端吻合或自体静脉移植术，适于瘤体较小的病例。
（2）动脉瘤切除，自体静脉或人工血旁路移植术。
（3）动脉瘤旷置术，结扎动脉瘤近心端和远心端，再行大隐静脉或人工血管间置术或旁路移植术，适于瘤体与腘静脉粘连严重的病例。
（4）瘤腔内血管重建术，部分切除瘤壁，缝扎瘤内动脉分支开口，于瘤腔内血管重建，最后用瘤壁包裹保护血管，适用瘤体较大，且与周围结构粘连严重的病例。
三、其他治疗
血管腔内治疗，因腘动脉跨越膝关节，且不能去除压迫，还有术后支架断裂的风险，故放置覆膜支架应慎重，最好避免此种治疗，尤其是对年轻患者。术前辅助溶栓治疗可以实现改善缺血、去除血栓、改善流出道条件的作用，能明确降低截肢率和增加手术后远期通畅率。