流行性脑脊髓膜炎的主要病因是脑膜炎球菌感染，致病菌由鼻咽部侵入血液循环，形成脓毒血症，最后局限于脑膜及脊髓膜，形成化脓性脑脊髓膜病变。流行性脑脊髓膜炎常好发于儿童、免疫力低下者。
一、主要病因
脑膜炎球菌归属奈瑟菌属，为革兰阴性球菌，成双排列，呈肾状，该菌仅存在于人体，可从带菌者鼻咽部，患者的血液、脑脊液和皮肤瘀点中检出。如人体免疫力强，病原菌在鼻咽部则可被迅速杀灭，或在鼻咽部定植而呈带菌状态；若体内缺乏特异性杀菌抗体，或细菌毒力较强时，则病菌可从鼻咽部黏膜进入血液，最终导致神经细胞的损伤，发展为败血症，继而累及脑脊髓膜，形成化脓性脑脊髓膜炎。
二、诱发因素
1、免疫力低下：正常人群即使感染脑膜炎球菌，由于免疫功能正常，可杀灭入侵的致病菌，如果机体免疫功能低下，不能杀灭入侵的致病菌，容易诱发流行性脑脊髓膜炎。
2、呼吸道病毒感染：呼吸道病毒感染时易合并脑膜炎球菌感染。