慢性肾衰竭的主要治疗原则为积极治疗原发病，可以阻抑或延缓疾病的进展，避免和纠正慢性肾衰竭进展的危险因素，防治相关并发症及替代治疗。慢性肾衰竭目前尚不能治愈，需要长期持续性治疗。
一、一般治疗
1、营养治疗：慢性肾衰竭病人蛋白摄入量一般为0.6~0.8g／(kg.d)，以满足其基本生理需要。磷摄入量一般应＜600~800mg/d；对严重高磷血症病人，还应同时给予磷结合剂。病人饮食中动物蛋白与植物蛋白应保持合理比例，一般两者各占一半左右；对蛋白摄入量限制较严格［(0.4~0.6)g／(kg.d)］左右的病人，动物蛋白可占50％~60％。 如有条件，病人在低蛋白饮食［(0.4~0.6)g／(kg.d)］的基础上，可同时补充适量的必需氨基酸和／或α酮酸，此时病人饮食中动物蛋白与植物蛋白的比例可不加限制。病人须摄入足量热卡，一般为30～35kcal／(kg.d)，以使低蛋白饮食的氮得到充分的利用，减少蛋白分解和体内蛋白库的消耗。
2、纠正酸中毒和水、电解质紊乱：
（1）纠正代谢性酸中毒：主要为口服碳酸氢钠(NaHCO3-)，必要时可静脉输入。可将纠正酸中毒所需之NaHCO3-总量分次给予，在48~72小时或更长时间后基本纠正酸中毒。对有明显心衰之病人，要防止NaHCO3-输入量过多，输入速度宜慢，以免心脏负荷加重；也可根据患者情况同时口服，或注射呋塞米，以增加尿量，防止钠潴留。
（2）水钠代谢紊乱的防治：为防止出现水钠潴留需适当限制钠摄入量，一般钠的摄入量应不超过6~8g/d。有明显水肿、高血压者，钠摄入量一般2~3g/d，个别严重病例可限制为1~2g/d。也可根据需要应用襻利尿剂，对慢性肾衰竭病人不宜应用噻嗪类利尿剂及贮钾利尿剂，因此时疗效甚差。对严重肺水肿急性左心衰竭者，常需及时给予血液透析或持续性血液滤过，以免延误治疗时机。对慢性肾衰患者轻、中度低钠血症，一般不必积极处理，而应分析其不同原因，只对真性缺钠者谨慎地进行补充钠盐。对严重缺钠的低钠血症者，也应有步骤地逐渐纠正低钠状态。对“失钠性肾炎”患者，因其肾脏失钠较多，故需要积极补钠，但这种情况比较少见。
（3）高钾血症的防治：当肾小球路过率（GFR）＜25ml/min时，即应限制钾的摄入，当GFR＜10ml/min 或血清钾水平＞5.5 mmol/l时，则应严格限制钾摄入。在限制钾摄入的同时，还应及时纠正酸中毒，并适当应用襻利尿剂增加尿钾排出。对已有高钾血症的患者，应采取积极的降钾措施：
（1）及时纠正酸中毒，除口服碳酸氢钠外，必要时可静滴碳酸氢钠根据病情需要可重复给予。
（2）给予襻利尿剂：最好静脉或肌肉注射呋塞米或丁尿胺，必要时将剂量增大。
（3）应用葡萄糖-胰岛素溶液静滴输入。
（4）口服降钾树脂，增加肠道钾排出，以聚苯乙烯磺酸钙更为适用，因为离子交换过程中只释放离子钙，不致增加钠负荷。
（5）对严重高钾血症且伴有少尿、利尿效果欠佳者，应及时给予血液透析治疗。
二、药物治疗
1、血管紧张素转化酶抑制剂或血管紧张素II受体拮抗剂：
（1）卡托普利、缬沙坦等降压药，用于降血压。血管紧张素转化酶抑制剂(ACEI)/血管紧张素II受体拮抗剂(ARB)两者不宜联合使用。
（2）对老年人或肾功能不全患者，使用ACEI或ARB时，需密切观察血肌酐和血钾的变化；血肌酐＞256µmol/L时慎用ACEI和ARB。
2、利尿剂：
（1）呋塞米、布美他尼、托拉塞米、氢氯噻嗪、螺内酯等，可用于肾病患者的利尿消肿和辅助降血压。
（2）呋塞米、布美他尼、氢氯噻嗪用于利尿、排钠、排钾，用药后需注意低钾血症；托拉塞米的排钾作用较弱；螺内酯可以保钾利尿；严重肾衰竭患者用保钾利尿药易产生高钾血症；这些药可能有胃肠道恶心、呕吐等不良反应。
3、重组人促红素：
（1）用于肾衰竭合并血红蛋白＜110g/L的患者，纠正肾性贫血，一般皮下注射或静脉注射；
（2）血红蛋白上升至120g/L为达标，在维持达标的前提下，适当减少重组人红细胞生成素用量；在应用重组人红细胞生成素的同时需评估体内是否缺铁，如血清铁蛋白＜100μg/L，血清转铁蛋白饱和度＜20%时，建议患者静脉补铁。
4、铁剂：
（1）蔗糖铁静脉滴注使用，首次静脉补铁需进行测试，防治过敏。
（2）轻度缺铁者，可口服药物补铁，如硫酸亚铁、富马酸亚铁、生血宁片。
三、手术治疗
肾移植是最佳的替代疗法。病人通常应先做一段时间的透析，待病情稳定并符合有关条件后，再考虑进行肾移植术。成功的肾移植可使患者恢复正常的肾功能，包括内分泌和代谢功能。移植肾可由尸体或亲属供肾，要在ABO血型配型和人类白细胞抗原配型合适的基础上，选择供肾者，近年肾移植的疗效已明显改善。肾移植术后为防止发生排斥反应，患者需长期使用免疫抑制剂，如糖皮质激素、环孢素A、硫唑嘌呤等，所以术后并发感染的患者数量增加，恶性肿瘤的患病率也有所增高。
四、其他治疗
1、血液透析：血透前3~4周，应预先给患者做动静脉内瘘，以形成血流通道。血透治疗一般每周做3次，每次4～6小时。在开始血液透析4～8周内，尿毒症症状逐渐好转。如能长期坚持合理的透析，不少患者能存活10~20年以上。但透析治疗间断地清除溶质的方式使血容量、溶质浓度的波动较大，与生理状态有相当差距，需进一步改进。
2、腹膜透析：持续性不卧床腹膜透析疗法，设备简单，易于操作，安全有效，可在患者家中自行操作。每日将透析液输入腹腔，并交换4次(一次6小时)，每次约2L。它是持续地进行透析，持续地清除尿毒症毒素，血容量不会出现明显波动。在保存残存肾功能方面优于血透，费用也较血透低，尤其适用于老人、糖尿病患者、小儿患者或做动静脉内瘘有困难者。