脑透明隔间腔形成是先天性发育异常导致，这是一种生理性发育异常，大多数没有临床症状，都是在进行头颅CT或者磁共振影像学检查时意外发现的。患者的两侧侧脑室间有一个透明隔，是两层紧密贴合在一起的膜，中间有个潜在的腔隙。
如果患者发育正常，成年后两层膜中间的腔隙闭合，肉眼无法观测到，患者存在四个脑室，包括左右的侧脑室以及第三、第四脑室。如果患者发育异常，导致透明隔间腔内出现脑脊液，会形成透明隔囊肿，在临床上可以观察到第五脑室形成。
这个脑室位于两侧的侧脑室之间，没有明显的临床症状，也不具有生理功能，不需要对其进行处理。如果囊肿进行性增加，里面的脑脊液越来越多，有可能对周围产生压迫症状，需要考虑手术治疗。