小儿乙型病毒性脑炎后遗症一般有偏瘫、尿潴留、痴呆等；严重的患者可能会出现终身瘫痪等后遗症。因此为了避免严重的后遗症出现，应该要在疾病确认后尽快接受治疗。如果是单纯疱疹病毒引起的脑炎，可以在医生指导下使用阿昔洛韦等药物来进行治疗；若是受到EB病毒引起的脑炎，则需要在医生指导下使用更昔洛韦来进行治疗。若患者存在有颅高压症状，则需要做降温治疗。