肠炎可以是不同的原因所引起，并且根据病程也可以分为急性跟慢性，所以治疗的方法也是各不相同的。对于急性肠炎，往往都是感染所引起来的。最常见的就是细菌感染，在这种情况下，有可能需要用一些抗生素，比如说黄连素，有可能帮助控制肠炎。还有比如说病毒引起来的，经过饮食的改善以及休息、补充脱水的量，不需要用抗生素，也可能自行缓解。
还有一些就是食物不耐受，比如说吃了海虾导致的肠道蠕动过快，这种过敏性的反应，引起的急性肠炎，需要避免进食不当的食物，特别是要注意找出过敏的食物，才能有效地治好肠炎。慢性的肠炎是由各种各样原因所引起来的，比如说溃疡性结肠炎，治疗需要特殊的药物，比如说轻度可能就用美沙拉嗪的药物，重度有可能就要糖皮质激素来诱导缓解。在这种情况往往都含有大便有黏液或者有血，一定要及时地到医院就诊。除了这种情况，比如说肠道蠕动过快、甲状功能亢进引起来的慢性肠炎，还要治疗基础病，比如说甲亢，才能有效地来缓解肠道的疾病。