肝癌的局部化疗是指应用微创手段，将化疗药物注入到瘤体或瘤体附近组织，从而使瘤体缩小的方法。因为上述方法是微创手术，所以手术痛苦很小。化疗药物是局部应用，相比全身化疗，局部化疗仅仅会出现轻度的消化道反应，如轻度恶心和食欲下降，往往不会出现呕吐反应，还会有轻度的血液系统反应，如轻度贫血、白细胞下降、血小板下降等。
部分局部化疗患者还会有发热的现象，在进行预处理后体温基本会降至正常范围内。进行肝癌局部化疗，大多数患者对于副作用均可耐受，反应很轻，可以说不痛苦，但是患者个体化差异非常大，虽然大多数在局部化疗时不痛苦，也有很少一部分患者即使是局部化疗，反应也比较重。