无痛性甲状腺炎是自身免疫性甲状腺炎的一个类型，与HLA-DR3、HLA-DR4、HLA-DR5相关，20％~25％的患者一级亲属存在自身免疫疾患。
1、免疫因素：无痛性甲状腺炎是患者原已存在的亚临床甲状腺炎在产后免疫反弹所致，其与细胞免疫及体液免疫均有关。母体的免疫系统在孕期主要表现为免疫抑制增强，抑制性T细胞的活性增加。产后母体的免疫抑制逐渐解除，辅助性T细胞/抑制性T细胞的比值增高，辅助性T细胞的活性增强，这种免疫反跳对敏感个体的明显刺激，导致无痛性甲状腺炎的发生。
2、吸烟：烟草中的硫氰酸盐通过甲状腺代谢，并抑制碘转运，同时硫氰酸盐是血小板生成素的竞争底物。吸烟还可能影响免疫系统，使单核吞噬细胞的清除功能发生变化，并产生较多的细胞炎性因子。
3、催乳素：催乳素诱导甲状腺细胞表面抗原细胞间黏附分子-1(ICAM-1)和高血小板生成素水平的表达，因此产后哺乳妇女分泌的催乳素很可能是无痛性甲状腺炎的主要致病因子之一。
4、药物：胺碘酮、干扰素、IL2及锂剂等药物均可引起无痛性甲状腺炎，与其他类型的甲状腺炎不同，本病持续时间很长。药物导致的甲状腺炎无甲状腺肿大或仅轻度肿大，可在初始治疗后任何时间出现甲状腺毒症，甲状腺摄碘率降低。
5、病毒感染：病毒感染可为发病诱因，致不同个体产生不同程度细胞免疫反应及某些特异个体产生自身免疫性抗体，从而引起无痛性甲状腺炎。