HPV疫苗的注射和同房之间并没有明确的禁忌，也就是说HPV疫苗和同房互相并不妨碍。一般来说在注射HPV疫苗之前是要检查是否有感染过这个病毒，所以需要做宫颈的防癌检查、宫颈HPV病毒的检查。如果病毒阴性，注射疫苗才会有它的作用，否则可能会导致注射疫苗效果的失败。
注射以后并不需要严格不能同房，但是尽量因为疫苗效果产生需要一定的时间，比如大多数需要半个月到一个月的时间。在这期间如果同房为安全起见可以戴避孕套，避孕套一方面有避孕的作用，另一方面有很好的防护病毒交叉感染的作用，所以也叫安全套。从这个角度讲打完疫苗以后坚持戴避孕套，防止在抗体产生保护作用之前感染病毒就可以。