孕激素主要由卵巢黄体分泌，作用于全身各器官，在不同器官有不同的作用。对于子宫内膜来说，孕激素可以对抗雌激素，抑制子宫内膜细胞的增殖，可以完善子宫内膜细胞的功能，促进内膜细胞糖原沉积，为胚胎着床做准备。孕激素也促进宫颈黏膜和阴道黏膜分泌黏液，一般会导致孕期分泌物增多，有一定的保护作用。孕激素与雌激素协同作用，可以促进乳腺增生，雌激素促进乳腺腺管细胞增生，而孕激素促进乳腺腺泡细胞增生。孕激素也会使体温有所升高，也会抑制胃肠平滑肌蠕动。