治疗习惯性流产一般在孕期采取口服孕激素和雌激素，如果有免疫异常，需要口服免疫抑制剂，另外加上口服阿司匹林，皮下注射低分子肝素钠来治疗。
尽量寻找习惯性流产的原因，针对病因进行治疗。如果是甲状腺功能异常引起的习惯性流产，在备孕时要将甲功调节到正常水平。怀孕早期由于受HCG的影响，甲状腺功能变化较大，因此需要定期复查，及时调整。