由于引起甲状腺功能减退的病因不同，甲减在服药以后激素水平正常，是否需要停药，结合患者具体情况来决定。如果是亚急性甲状腺炎、产后甲状腺炎，甚至抗甲状腺药物引起的药物性甲减，随着亚急性甲状腺炎和产后甲状腺炎、甲亢完全康复，不需要长期服药。
但是如果是桥本甲状腺炎引起的终身性甲减，即使是甲状腺功能服药以后正常，也不能停药。需要长期维持定期复查，不能自己擅自的减药、停药。如果是怀孕期间亚临床甲减或者是临床甲减，更不能在甲功正常的时候停药。如果停用药物，甲状腺功能还会出现甲状腺激素水平降低，造成围产期的并发症，后代的智力会受影响。