孕期甲亢对胎儿容易造成早期流产，以及胎儿发育不良，甚至是胎儿畸形的影响。但是，孕期甲亢要关注是HCG相关性的甲亢，还是真正的甲亢。如果是HCG相关性甲亢，通常与孕吐、HCG水平、多胎妊娠相关，出现一过性的甲状腺激素水平升高。随着孕周的增加，甲状腺激素水平会逐渐回落，这种与HCG相关性的孕期甲亢，并不需要进行特殊处理，通常对胎儿并不会造成太大的不利影响。
如果是孕期合并有甲状腺功能亢进症，也就是甲状腺本身的原因所导致，T3、T4、游离T3、游离T4水平异常升高，对于胎儿生长发育确实会带来影响。因为甲状腺功能如果没有控制良好，妈妈处于高分解状态，会导致胎儿的营养素供应不足，导致胎儿无法有正常的良好生长环境，则在早期容易出现流产的情况，而且在发育过程中胎儿容易出现生长发育不良，也容易出现畸形的情况。所以对于孕期甲亢要注意观察，注意鉴别，最终决定治疗方案。