间质瘤一般发生在腹腔及胃肠道。间质瘤，一旦明确诊断，及早行手术治疗。手术切除困难，可选用药物治疗。如局部进展，不可切除，可以进行术前药物治疗。如果患者术后仍存在转移复发病灶，只要患者耐受也应选用药物治疗。间质瘤的治疗药物包括分子靶向药物伊马替尼及舒尼替尼。经手术及分子靶向药物的综合治疗，间质瘤的生存期大大提高。中位生存期可以达到46个月。