女性经常口腔溃疡的原因很复杂，目前病因还不是很确定，存在着分歧。有的人认为和免疫系统有关，得了口腔溃疡的人，往往细胞免疫或者体液免疫出现异常。还有的人认为和遗传有关，往往具有家族易感性。还有人认为和一些全身系统性疾病有关，比如反复口腔溃疡的人，也容易出现胃溃疡、肠黏膜的溃疡，或者溃疡性结肠炎。也有的人认为和内分泌系统功能紊乱有关，比如在女性，就经常在月经期出现口腔溃疡，这就和内分泌系统，雌激素或者孕激素的增加或者减少有关，还有的人认为复发性口腔溃疡还和血液黏稠度有关。