眼肌型重症肌无力有可能治愈，这种类型的重症肌无力是所有类型当中最轻的一种，只有眼肌受累。如果发生在儿童，可能和儿童胸腺发育未完全有关系，20岁以后儿童长到成年，其胸腺功能发育完善就有可能自愈，甚至不需要其他治疗。
如果发生在成人，要检查患者有无合并胸腺瘤或其他自身免疫性疾病，合并胸腺瘤或胸腺增生的患者可以考虑手术治疗，切除胸腺瘤以后还要给予激素或者免疫抑制剂治疗，在5年之后就有几率完全治愈。
如果合并其他自身免疫性疾病，病程也有可能出现反复，迁延不愈，主要看这种免疫性疾病本身是否有治愈的可能性。