食管壁内假性憩室多数患者不需治疗，轻症患者给予药物治疗缓解。对于有明显吞咽困难者需手术扩张食管治疗，多数患者的治疗周期为6~8周。
一、药物治疗
1、奥美拉唑：属于质子泵抑制剂，有抑制胃酸分泌，保护胃黏膜的作用，主要用于减轻食管损害处胃酸的刺激。旨在缓解疼痛症状，促进破损部位愈合，防止并发症。
2、枸橼酸铋钾：属于胃黏膜保护剂，有助于溃疡愈合，提高溃疡愈合质量。不宜与多酶片合用，否则两者疗效均降低。
3、多潘立酮：对于食管壁内假性憩室导致的胃肠功能紊乱有良好的效果，促进胃肠蠕动。有助于胃排空，减轻患者恶心、呕吐的症状。部分患者会有皮疹、嗜睡的不良反应。
4、氟康唑：属于抗真菌药物，适于合并真菌感染的患者，能有效抑制真菌生长促进食管损伤部位愈合，部分患者有皮疹、胃肠不适的副作用。
二、手术治疗
食管扩张术，适于有明显吞咽困难的患者，通过内镜下球囊充气将食管狭窄部位扩张。手术创伤小、效果好、术后并发症少。该手术无开放伤口，不需放置胃管，一般患者术后当天即可进流质饮食。