做直肠息肉手术有两种方法：第一种，在电子结肠镜下切除直肠息肉；第二种，经肛门手术切除直肠息肉。支配直肠黏膜的神经是自主神经，而自主神经是没有疼痛感觉的，只有支配皮肤的躯体神经才有疼痛的感觉，所以内镜下切除切除直肠息肉不疼痛，如果直肠息肉直径较大，需要经肛门手术切除直肠息肉，虽然直肠息肉的切除部位没有疼痛感觉，但是因为经肛门切除过程中的牵拉以及肛门扩张，可能会有肛门部位的轻度疼痛，一般疼痛不重。