小儿白塞病的主要症状多为反复口腔溃疡、会阴部溃疡皮疹，眼部病变。常见症状有口腔溃疡，生殖器溃疡，眼部出现眼红病、疼痛、畏光、视力下降；皮肤表现为面部，胸背部或者是其他部位青春痘样皮疹，关节会出现疼痛或肿胀，吞咽困难或者是吞咽时胸痛、反酸、烧心等消化的症状，手脚不灵活，头晕头痛，等神经要改变。部分患儿还会伴有乏力，纳差，低烧、纳差等全身症状。