格子状角膜营养不良是一种遗传性疾病，由基因变导致，目前还没有特异而有效的预防方法。对于存在格子状角膜营养不良家族史者，建议定期进行眼部检查，早期发现、早期治疗，是预防该病最有效的方法。
患格子状角膜营养不良人群，通常伴有家族病史，因基因突变导致，大多于童年发病，并无良好的预防措施。建议平时避免强光、紫外线照射，会降低该病的发生率。