中毒型菌痢是痢疾杆菌通过消化道进入人体内后引起的急性消化道传染病。由于细菌的内毒素引起急性微循环障碍而使组织缺氧，进而引发一系列危急重症。本病好发于儿童，免疫力低下者。
中毒性菌痢的病原是痢疾杆菌、属于肠杆菌的志贺菌属，分A、B、C、D四群(志贺菌、福氏菌、鲍氏菌、宋内氏菌)我国以福氏、志贺菌多见。志贺菌属经口进入胃肠道，依靠其毒力质粒所编码的一组多肽毒素侵入结肠上皮细胞，并生长繁殖，细菌裂解后产生大量内毒素与少量外毒素中毒型痢疾的发生机制尚不十分清楚，可能和机体对细菌毒素产生异常强烈的过敏反应(全身炎症反应综合征)。