目前对于血管瘤的病因、发病机制尚未清楚。其形成可能由多种原因导致，如血管形成因子与血管形成抑制因子之间的平衡失调、细胞外基质和蛋白酶表达变化以及某些致病基因的突变或抑癌基因的失活，引起局部微环境的变化和内皮细胞异常转化，从而导致血管内皮细胞的增殖异常。
此外，女性妊娠期，长期接触油漆、涂料或其他化工物质，可能会增加新生儿发生血管瘤风险。