做胃镜也有很多的禁忌症，比如有严重的心肺疾病或处于休克昏迷等不能耐受的人群是不适合做胃镜的。
另外疑似有上消化道穿孔、腹膜炎、腹水、严重腹胀者，不适合做胃镜。对于有颈椎外伤，脊柱畸形及不配合患者，吞食腐蚀性物质的急性期有出血性疾病患者不适合做胃镜。一般来说胃镜检查的适应症包括以下几点：
1、反复腹痛，尤其是上腹部及脐周疼痛。
2、上消化道出血。
3、经常性呕吐。
4、有明显的消化不良症，如厌食、反酸、嗳气、上腹饱胀烧心等。
5、应用胃镜治疗疾病，比如消化道的异物、息肉的摘除。
6、还可以检查原因不明的贫血。
7、不能用心肺疼痛解释的胸骨后疼痛，需要做一下胃镜。