甲状腺过氧化物酶抗体＞1000IU/ml是不是严重，要根据患者甲状腺功能水平的改变，以及甲状腺功能对人机体的改变来判断。客观来说，甲状腺过氧化物酶抗体＞1000IU/ml，提示甲状腺处于炎症活动状态，也是处于免疫反应比较严重的状态。
这种情况下，患者的甲状腺功能处于活跃状态，具体需要查甲状腺功能，判断甲状腺功能到底是甲亢还是甲减。其次，根据甲状腺功能，再判断甲状腺功能亢进或甲减，对患者心脏、大脑、全身系统有无并发症的影响，进一步判断是否严重。