更年期抑郁症需要与更年期综合征、药源性抑郁症、广泛性焦虑障碍相鉴别。
1、更年期综合征：更年期综合征是指更年期前后出现激素不稳定而导致的一系列躯体及精神的症状，主要表现有潮热、潮红、出汗、失眠、情绪波动、注意力差等，女性还常有月经紊乱，男性常有体能下降、性功能减退表现。而更年期抑郁症除可有上述症状外，抑郁情绪更重，达到了抑郁发作的诊断标准，具有情绪低落、兴趣减退、自我评价低、悲观失望等抑郁症的核心症状，严重者会发生自伤、自杀行为。
2、药源性抑郁症：药源性抑郁症有服用可致抑郁症状的药物的病史，属于外源性抑郁症，通常无器质性的病变或功能障碍。而更年期抑郁症一般无服用药物病史。
3、广泛性焦虑障碍：广泛性焦虑障碍是对多种境遇的过分焦虑和担忧，以自主神经功能兴奋和过分警觉为特征的一种慢性焦虑障碍。主要表现为对外界刺激敏感、运动性不安、肌肉紧张及心动过速等症状。而更年期抑郁症除可有上述症状外，还有思维迟缓、精力疲乏等典型症状。