1、妇科检查：通过妇科检查了解子宫大小、活动度、有无压痛、宫颈有无举痛，以及附件区有无包块、结节等。
2、腹部B超检查：可观察到盆腔子宫内膜异位及肿块。
3、妇科CT检查：常用于诊断子宫内膜异位囊肿及子宫腺肌病，但缺乏特异性，其中子宫内膜异位囊肿通过CT检查可表现出特异性征象，囊内局灶性高密度灶代表凝血块，液性部分不强化。另外，CT引导下的穿刺性病理学诊断有利于肿块性质的确定，术前对内膜异位症的患者进行CT等影像学检查也具有一定的临床意义。
4、妇科MRI检查：MRI软组织分辨率高，同时能够进行多序列、多方位成像，且具有无创及无辐射的优点，加之继发性痛经症患者的MRI征象均具有一定的特征，因此，MRI在继发性痛经诊断中具有特殊优势，常规序列即能直观、全面显示各种器质性病变的性质并能够准确定位，确定病变范围。但在用MRI诊断盆腔子宫内膜异位症时，因经期出血及月经周期等因素，容易混合新旧病灶，有一定的误差率。
5、血CA125：CA125(肿瘤标志物)源自于体腔上皮细胞的表面抗原，可高表达于各种体液中。CA125的高低会随着内膜异位症的分期增高而变化，因此，CA125值增高可作为判断其严重程度的一个重要辅助指标。
6、腹腔镜：腹腔镜是目前诊断子宫内膜异位症的金标准，不仅对于检查、诊断各期内异症有重要意义，而且腹腔镜手术治疗也可减灭病灶，减轻疼痛，改善和促进生育功能以及减少复发。
7、子宫输卵管造影：可辅助诊断先天性子宫畸形、宫腔粘连等。