1、体格检查：体格检查可触及右上腹肿块或肝大，肿块与肝相连，带囊性感，无明显压痛并可随呼吸上下移动，多发性肝囊肿可在肝表面触及多个囊性软结节。
2、肝脏Ｂ超：B超为诊断肝囊肿的首选方法，典型表现为圆形或椭圆形的液性暗区，壁薄，边界清晰、光滑，后壁及深部组织回声增强。
3、肝脏CT和MRI：可明确囊肿的大小、部位、形态和数目，CT显示肝囊肿为境界清楚的圆形或椭圆形低密度区，边缘清晰、光滑，注射造影剂后病灶无增强，与周围肝组织对比明显提高。
4、免疫学检查：包括酶联免疫吸附试验、间接血凝法等，主要用于辅助诊断肝包虫病。
5、血常规检查：通过检查可以确定患者白细胞、血细胞、中性粒细胞的计数，明确患者是否存在炎症反应，确定肝脏是否存在炎症疾病。
6、组织活检：通过该检查可以确定患者是否存在癌症病变，以及疾病的严重程度。