曲霉菌肺炎临床有三种类型，治疗各不相同。侵袭性肺曲霉病是最常见的类型，组织破坏严重，治疗困难。首选的治疗药物是两性霉素B，但是对药物的疗程、总剂量，目前还没有统一的意见。第二种临床类型是曲霉肿，又叫曲菌球，这种类型的治疗主要是预防威胁生命的大咯血，支气管内或脓腔内注入抗真菌药或口服伊曲康唑可能有效。第三种临床类型是变应性支气管肺曲霉病，这种患者需要使用糖皮质激素，重症患者加用抗曲霉菌治疗。