脑脊液蛋白主要来源于血液中透过血脑屏障的蛋白，小部分是由中枢神经系统合成的蛋白。因此，脑脊液蛋白含量的变化反映了血脑屏障的通透性或鞘内蛋白的分泌情况。因此，只要能导致血脑屏障破坏的因素均可导致脑脊液蛋白偏高，比如中枢神经系统感染（结核性脑膜炎、化脓性脑膜炎、颅内感染）、脱髓鞘疾病、颅脑外伤、脑肿瘤等。