甲硝唑是用来治疗厌氧菌感染引起的各种疾病，比如腹腔消化道，女性生殖系统，下呼吸道，皮肤以及软组织，骨和关节等部位的厌氧菌感染。不良反应以消化道反应最常见，包括恶心，呕吐，食欲不振，腹部绞痛，一般不影响治疗。偶尔会有头痛，眩晕，感觉异常。孕妇以及哺乳期妇女禁止使用。肝脏疾病的患者有症状，需要使用甲硝唑类的药物，剂量要减少。