粒细胞缺乏症通常是一种继发性疾病。对继发性疾病的治疗主要针对原发疾病，对于白细胞减少和粒细胞缺乏的患者，必须找到起病原因。如果是药物，常见的有抗肿瘤药、氯霉素、磺胺类药物、解热镇痛药等等以及一些化学物质，比如苯、二甲苯以及有机溶剂等等，还有放射线、X线、放射性同位素等等引起，我们必须停止应用这些药物，或停止接触能够引起粒细胞缺乏的物质。如果是感染引起，一般像伤寒、败血症、肝炎或其他慢性疾病，如慢性再生障碍性贫血、急性白血病、系统性红斑狼疮，我们必须要针对病因进行治疗。