引起肌肉肿痛的原因有很多，第一，大多数情况下是由于肌肉过度疲劳导致的，过度的运动造成肌肉拉伤、肌肉痉挛、肌组织异常等，出现肿痛的现象。第二，特殊情况下，感染性疾病比如中东呼吸综合症、流行性腮腺炎、疟疾等疾病过程中，均可出现体温持续高热的状况，随之出现反复寒颤，全身肌肉酸痛的现象。第三，反复紧张性损伤症，肉芽肿伴发的葡萄膜炎等也常出现肌肉肿痛的症状。第四，风寒侵袭，感染风寒湿往往也是肌肉肿痛的原因。