办理健康证是可以喝水的。有的体检项目是要求不能喝水的，比如上消化道的钡餐检查，喝水以后硫酸钡在胃部不能停留，导致检查失败。胃镜检查的时候也是不能喝水的，喝水会影响镜下的视觉效果。办理健康证的时候是不要求以上项目的，因此一般情况下是可以喝水的，尽量的早晨，空腹到医院去办理，并且携带本人的身份证，要注意的是需要做大便检查。