克罗恩可以出现在肠道的任何部位，好发回肠末端局限性的小溃疡，早期溃疡侵犯不深只是肠道黏膜层散发性的局限水肿和鹅卵石样分布肠道内壁，有肚脐周围的阵发性隐痛，伴有肠鸣，餐后加重大便后缓解些，炎症加重可以出现剧烈疼痛；大便异常呈糊状不成形，没有出血和粘液，营养吸收障碍，有消瘦表现；急性发作可以伴有发热；常有肠道外口腔溃疡表现。