眨眼症患者的治疗除了给予药物治疗外，还可给予心理治疗以及社会治疗，若患者是由于抽动障碍引起的眨眼症，则治疗及康复需要时间较长，对于预防和复发问题，应及时给予患者指导和帮助，还应根据患者的具体情况和需要及时调整治疗方案。
一、药物治疗
1、抗生素类药物：
（1）青霉素：其属于β-内酰胺类抗生素，是使用最广泛的一类抗生素。对于奈瑟菌性结膜炎和淋球菌性结膜炎效果良好，新生儿可采用静脉滴注或者肌注，青霉素过敏者严禁使用。
（2）头孢曲松钠：为β-内酰胺类抗生素、头孢菌素类药。成人常采用肌注或者静脉给药，对头孢菌素类抗生素过敏者禁用，应用本品期间和以后数天内，应避免饮酒和服含酒精的药物。
2、抗病毒药物：常用的类型为利巴韦林滴眼液，为无色透明液体，可用于单纯疱疹病毒性角膜炎，偶见局部轻微刺激，对本品过敏者、孕妇禁用，有心脏病史或心脏病患者禁用。
3、抗抑郁药物：常用的抗抑郁药物有帕罗西汀和氟西汀。帕罗西汀用于治疗抑郁症，缓解患者的社交恐惧和焦虑障碍。氟西汀主要用于治疗惊恐状态，对广泛性焦虑障碍也有缓解作用。
4、抗精神焦虑药物：
（1）硫必利：对于抽动障碍的有效率为70%~80%，该药物的副作用较轻，少数患者可出现嗜睡、乏力、头晕、胃肠道不适、失眠等副反应。
（2）奥沙西泮：口服此药物易于吸收，能有效缓解失眠症状。
二、手术治疗
眨眼症一般无需手术治疗。