完全性大动脉转位主要是手术治疗，辅助药物治疗改善心血管功能，从而提高患者生活质量。
一、药物治疗：
常见前列地尔，可使肺动脉压下降，并保持动脉导管开放、缓解缺氧状态、改善心功能，延长患儿生存时间，为进一步手术创造条件。
二、手术治疗：
1、球囊房隔成形术：因患儿年龄小，可能无法一下子承受根治手术，有时医生会在根治手术前先进行一些“预备性”手术，比如本项手术，可以使患者的症状暂时缓解，各个器官发育到一定水平，再进行根治手术。
2、肺动脉环缩术：也是“预备性”手术。目的是预防充血性心力衰竭，为根治手术做准备。
3、大动脉调转术：属于根治手术。该手术的目的是恢复患儿正常的心血管循环结构。