蛛网膜囊肿属于先天性疾病，该疾病一般不会引起相应临床症状，所以不需要治疗，定期随访即可。但是有部分患者会由于蛛网膜囊肿逐渐增加，导致颅内压增高及神经功能缺损症状，对于该类蛛网膜囊肿需要进行手术治疗。
如果其引起，比如头痛、恶心、呕吐和嗜睡等颅内压增高症状，癫痫、脑积水、脑干功能障碍及视力障碍需要进行手术，手术方式主要包括：钻孔针管抽吸、引流；
开颅手术切除囊壁，使之与基底池沟通。钻孔经内镜穿通囊肿，囊肿-腹腔和静脉分流手术。