小脑幕切迹疝和枕骨大孔疝的区别主要在于发病机制、临床表现不同，具体如下：
1、发病机制不同：小脑幕切迹疝主要是由于大脑幕上组织通过小脑幕切迹挤向同侧大脑角所致，而枕骨大孔疝是由于幕下小脑扁桃体通过枕骨大孔挤向椎管，压迫延髓所致；
2、临床表现不同：枕骨大孔疝患者病情变化快于小脑幕切迹疝，小脑幕切迹疝患者可以表现为对侧肢体偏瘫、动眼神经受压，从而导致同侧瞳孔散大、眼球外展固定、上睑下垂，同侧大脑后动脉挤压到小脑幕切迹上可致同侧枕叶出现脑梗塞。环池受压之后可以发生脑脊液循环障碍，从而加重患者颅内压增高情况。而枕骨大孔疝会突然压迫延髓，很容易引起呼吸骤停。