甲型流感的症状与感冒存在明显差异，流感的患者表现为高热，体温多数在39℃左右，伴有咽痛或者咳嗽，有明显的全身感染中毒症状，出现头疼、畏寒、全身关节肌肉酸痛，恶心、食欲减退，可以出现消化道的症状，腹痛或者腹泻。
甲型流感的患者，部分患者还可以出现下呼吸道的感染，可以引起流感肺炎。对于普通的感冒来说，一般情况下不发烧，有些患者出现发烧也仅仅是低热，而且很快自行消退，主要表现是呼吸道的卡他症状，打喷嚏、流鼻涕、鼻塞，而基本不伴有全身的感染中毒症状，所以两者的区别还是比较明显的。