锁骨骨折后遗症主要是疼痛，肩关节的活动障碍以及骨不愈合。疼痛主要是由于骨折后局部组织产生的瘢痕化导致的瘢痕疼痛，肩关节的活动障碍是因为锁骨骨折后，一般肩关节需要保护4-6周的时间才可以活动，否则对于骨折的愈合是不利的，在4-6周的制动时间后进行功能锻炼，容易引起肩关节的活动障碍。骨不愈合，是由于锁骨本身的血运比较差，有时会不容易愈合。多数情况下的锁骨骨折是没有后遗症的。