颅骨巨细胞瘤，主要是由于其生长会引起颅神经障碍、颅内压增高，因此需要进行早期积极的干预。其治疗最主要以彻底切除肿瘤为主，但是颅骨巨细胞瘤常常位于颅底，并侵蚀邻近的骨质，给肿瘤的全切带来很大困难。因此肿瘤很容易复发，尤其是恶性的骨细胞瘤更容易复发，多数患者复发均在手术后两年以内。复发的肿瘤治疗，仍然是以手术切除为主，恶性骨细胞瘤术后可考虑放疗；但良性的骨细胞瘤对放疗不敏感，而且放疗可能会导致肿瘤的恶变。